中国康复医学杂志

作者：陈建敏,王志勇,张楠楠,陈清法,

单位：福建医科大学附属第一医院康复医学科，福建省福州市，350005

关键词：缺血性脑卒中生物信息学GEO数据库ceRNA调控网络生物标志物

基金：福建省科技创新联合资金引领项目（2020Y9110）；福建省卫生健康青年科研课题（2020QNA044）；福建医科大学启航基金（2019QH1026）

目的：利用生物信息学分析筛选缺血性脑卒中（IS）的差异表达基因，构建竞争性内源RNA（ceRNA）调控网络，探讨IS的相关分子机制。方法：从GEO数据库下载IS相关的miRNA、mRNA和lncRNA测序数据，借助R软件获取差异基因，通过starBase、miRDB和 miRwalk数据库进行lncRNA- miRNA和miRNA- mRNA关系预测，并构建ceRNA网络。预测与差异分析的结果取交集后筛选出差异靶基因（DETmRNAs），利用 DAVID 数据库进行KEGG和GO富集分析，String 数据库构建蛋白互作网络（PPI），采用Cytoscape软件识别核心靶基因。结果：共筛选出存在明显差异表达的miRNAs 20个，mRNAs 1512个，lncRNAs 278个，并成功构建了5lncRNAs-6miRNAs-102mRNAs互作的ceRNA网络。筛选出的285个DETmRNAs所富集的功能主要包括染色质的组织、磷蛋白磷酸酶活性的负向调节和细胞周期等生物学过程，涉及白细胞经内皮迁移、血小板激活等信号通路，最终识别出排名前10的核心靶基因为CREB1、MAPK1、GSK3B、SP1、PIK3R1、NR3C1、NCOR1、NFATC1、SETD2、NSD1。结论：构建ceRNA网络有助于进一步认识IS的分子机制和筛选潜在的生物标志物，为后续康复治疗靶点的确定和制定康复策略提供一些线索。

来源：2024年第1期

《中国康复医学》期刊编辑部

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