中国康复医学杂志

作者：沈 鹏,柴欣萍,李昱彤,梁 颖,陈希文,黄子怡,熊 凤,冯 珍,

单位：南昌大学第一附属医院康复医学科，江西省南昌市，330000

关键词：神经病理性疼痛差异表达基因生物信息学

基金：国家重点研发计划项目（2020YFC2002904）

目的：通过生物信息学方法分析正常人与坐骨神经痛患者数据，从而筛选出神经病理性疼痛（neuropathic pain， NP）的潜在差异基因。方法：从基因表达数据库下载芯片数据GSE150408。用R软件的limma包筛选差异表达基因（differentially expressed genes，DEGs），使用clusterProfiler包进行基因本体论（gene ontology，GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG）通路分析，通过STRING数据库进行DEGs蛋白互作网络分析。结果：共筛选得到424个DEGs，包括233个上调基因和191个下调基因。GO富集分析表明DEGs主要分布在囊泡、分泌性颗粒、第三粒等细胞组分；参与防御反应、免疫调节过程、细胞激活、白细胞激活等生物学过程，同时发挥免疫受体激活、补体激活、MAP激酶磷酸化等分子功能。KEGG通路分析表明DEGs主要集中在癌症中的转录失调等通路；基因集富集分析（gene set enrichment analysis， GSEA）最显著富集的基因集为细胞内吞作用，疱疹病毒感染等。蛋白互作网络中上调蛋白FCGR1A的度值最高，下调蛋白SPTBN2的度值最高，这2个蛋白是关键节点。结论：NP的外周血液具有炎症和免疫特征，AZU1、BPI、FCGR1A、SPTBN2等4个基因是参与NP的关键基因。

来源：2024年第10期

《中国康复医学》期刊编辑部

查看中国康复医学杂志2024年第10期